Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TRIM63Q969Q1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM63Q969Q1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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TRIM63Q969Q1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TRIM63Q969Q1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TRIM63Q969Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM63Q969Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TRIM63Q969Q1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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TRIM63Q969Q1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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TRIM63Q969Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM63Q969Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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