Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX38Q92620 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DHX38Q92620 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms