Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKAP2Q8WWK9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKAP2Q8WWK9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKAP2Q8WWK9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms