Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELQQ8TDG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HELQQ8TDG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELQQ8TDG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELQQ8TDG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms