Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.994e-18■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 HECTD1-216ENST00000557321 571 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DEPDC5-221ENST00000497340 288 ntTSL 55.58□□□□□ -1.524e-18■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 ERCC6L2-202ENST00000320486 2936 ntTSL 1 (best)5.58□□□□□ -1.521e-9■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-212ENST00000576180 2288 ntTSL 212.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 DNAJA3-209ENST00000574393 577 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-206ENST00000485520 3185 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-204ENST00000471186 2100 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.183e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-13■■■■■ 62.2
PUM2Q8TB72 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.588e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-22■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-206ENST00000527902 619 ntTSL 316.61■□□□□ 0.258e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-216ENST00000533499 936 ntTSL 516.35■□□□□ 0.218e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.158e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-214ENST00000533048 922 ntTSL 514.07□□□□□ -0.168e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.688e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 NXF1-205ENST00000527497 529 ntTSL 27.37□□□□□ -1.238e-29■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-207ENST00000546636 2125 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-225ENST00000551215 609 ntTSL 58.02□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 62
PUM2Q8TB72 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 61.8
PUM2Q8TB72 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 61.7
PUM2Q8TB72 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 SNIP1-204ENST00000638725 2761 ntTSL 210.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 61.6
PUM2Q8TB72 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-10■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 CCDC162P-215ENST00000640771 4195 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.63□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 EIF4ENIF1-209ENST00000441289 597 ntTSL 39.5□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 61.5
PUM2Q8TB72 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 61.4
PUM2Q8TB72 SLU7-207ENST00000521320 492 ntTSL 24.92□□□□□ -1.621e-12■■■■■ 61.4
PUM2Q8TB72 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 61.3
PUM2Q8TB72 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 61.3
PUM2Q8TB72 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-323■■■■■ 61.3
PUM2Q8TB72 NR1D2-205ENST00000492552 1981 ntTSL 222.1■■□□□ 1.135e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NR1D2-202ENST00000383773 3129 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.385e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NIN-201ENST00000245441 10293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.655e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 C6orf136-205ENST00000460172 253 ntTSL 210.82□□□□□ -0.685e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 NIN-210ENST00000476352 10225 ntTSL 55.37□□□□□ -1.555e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 CCDC186-204ENST00000428953 1576 ntTSL 24.4□□□□□ -1.75e-12■■■■■ 61.2
PUM2Q8TB72 ZNF639-203ENST00000466663 814 ntTSL 37.91□□□□□ -1.144e-27■■■■■ 61.1
PUM2Q8TB72 ATP13A3-202ENST00000429136 3729 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.596e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.666e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.86e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.16e-16■■■■■ 61
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 220.2■□□□□ 0.821e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-211ENST00000533012 817 ntTSL 210.54□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-213ENST00000533149 1340 ntTSL 210.43□□□□□ -0.741e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-204ENST00000524797 1924 ntTSL 210.23□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-201ENST00000359005 849 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-323■■■■■ 60.7
PUM2Q8TB72 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 60.6
PUM2Q8TB72 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 60.6
PUM2Q8TB72 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-74■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-74■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-202ENST00000545307 1602 ntTSL 518.54■□□□□ 0.564e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-204ENST00000554402 1544 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.54e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-207ENST00000555229 1517 ntTSL 517.42■□□□□ 0.384e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-203ENST00000553907 780 ntTSL 310.4□□□□□ -0.744e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-205ENST00000554642 687 ntTSL 38.34□□□□□ -1.074e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 ACTR10-216ENST00000557711 1584 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.494e-14■■■■■ 60.5
PUM2Q8TB72 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-214ENST00000542027 1841 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-223ENST00000566850 1016 ntTSL 210.82□□□□□ -0.682e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-201ENST00000251143 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.412e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.462e-13■■■■■ 60.4
PUM2Q8TB72 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-18■■■■■ 60.1
PUM2Q8TB72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.232e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-220ENST00000639596 2108 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-219ENST00000639523 2137 ntTSL 59.71□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 MED17-223ENST00000640077 2210 ntTSL 55.44□□□□□ -1.542e-8■■■■■ 60
PUM2Q8TB72 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-17■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.712e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-201ENST00000219084 8739 ntTSL 1 (best)4.21□□□□□ -1.732e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.912e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.972e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.992e-24■■■■■ 59.8
PUM2Q8TB72 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.981e-17■■■■■ 59.7
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 580.3 ms