Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNPLA1Q8N8W4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA1Q8N8W4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA1Q8N8W4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms