Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN19Q8N6F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN19Q8N6F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN19Q8N6F1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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