Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A8Q8N695 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC5A8Q8N695 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC5A8Q8N695 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms