Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT222Q8N1A0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT222Q8N1A0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT222Q8N1A0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms