Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
R3HCC1LQ7Z5L2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms