Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
STRCQ7RTU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
STRCQ7RTU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
STRCQ7RTU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STRCQ7RTU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
STRCQ7RTU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms