Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q71RC1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q71RC1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q71RC1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q71RC1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q71RC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q71RC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q71RC1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q71RC1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q71RC1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q71RC1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q71RC1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q71RC1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q71RC1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q71RC1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q71RC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q71RC1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q71RC1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q71RC1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q71RC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q71RC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q71RC1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q71RC1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q71RC1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q71RC1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q71RC1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q71RC1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q71RC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q71RC1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q71RC1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q71RC1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q71RC1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q71RC1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q71RC1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms