Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC149Q6ZUS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC149Q6ZUS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC149Q6ZUS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms