Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRAMD4Q6IC98 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRAMD4Q6IC98 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRAMD4Q6IC98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms