Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms