Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMBRD2Q68DH5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMBRD2Q68DH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMBRD2Q68DH5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMBRD2Q68DH5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms