Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNS3Q68CZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TNS3Q68CZ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNS3Q68CZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNS3Q68CZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNS3Q68CZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms