Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QL3Q5VWW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QL3Q5VWW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QL3Q5VWW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms