Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR78Q5VTH9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR78Q5VTH9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
WDR78Q5VTH9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms