Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01545Q5VT33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC01545Q5VT33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms