Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
RSPH4AQ5TD94 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RSPH4AQ5TD94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.46
RSPH4AQ5TD94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RSPH4AQ5TD94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RSPH4AQ5TD94 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms