Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CC2D1BQ5T0F9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CC2D1BQ5T0F9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CC2D1BQ5T0F9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CC2D1BQ5T0F9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms