Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC158Q5M9N0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC158Q5M9N0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC158Q5M9N0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC158Q5M9N0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms