Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PAN3Q58A45 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAN3Q58A45 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms