Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALFQ53S48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALFQ53S48 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALFQ53S48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALFQ53S48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms