Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SVEP1Q4LDE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SVEP1Q4LDE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8266.7 ms