Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSX2Q16385 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SSX2Q16385 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SSX2Q16385 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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