Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNCBQ16143 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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