Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRP1BQ14684 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1BQ14684 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1BQ14684 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1BQ14684 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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