Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIGQ13278 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIGQ13278 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIGQ13278 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIGQ13278 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIGQ13278 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIGQ13278 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIGQ13278 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIGQ13278 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIGQ13278 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RIGQ13278 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIGQ13278 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIGQ13278 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIGQ13278 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIGQ13278 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIGQ13278 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIGQ13278 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RIGQ13278 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RIGQ13278 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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