Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA1Q09470 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA1Q09470 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA1Q09470 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNA1Q09470 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms