Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SOS1Q07889 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SOS1Q07889 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOS1Q07889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SOS1Q07889 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SOS1Q07889 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms