Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EXOSC9Q06265 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
EXOSC9Q06265 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EXOSC9Q06265 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
EXOSC9Q06265 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms