Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL6Q02878 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL6Q02878 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL6Q02878 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL6Q02878 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms