Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF2Q01130 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SRSF2Q01130 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SRSF2Q01130 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms