Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNA1P78396 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA1P78396 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNA1P78396 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms