Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PIP4K2BP78356 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PIP4K2BP78356 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PIP4K2BP78356 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PIP4K2BP78356 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PIP4K2BP78356 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PIP4K2BP78356 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms