Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A1P68400 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A1P68400 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2A1P68400 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A1P68400 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms