Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSNK2BP67870 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2BP67870 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms