Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-24P63145 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-24P63145 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-24P63145 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-24P63145 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms