Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVS71-1P61550 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVS71-1P61550 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVS71-1P61550 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms