Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00205P59089 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00205P59089 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00205P59089 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms