Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00310P59036 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00310P59036 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms