Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AQP4P55087 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AQP4P55087 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AQP4P55087 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AQP4P55087 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AQP4P55087 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AQP4P55087 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AQP4P55087 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AQP4P55087 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AQP4P55087 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AQP4P55087 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AQP4P55087 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AQP4P55087 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AQP4P55087 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AQP4P55087 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AQP4P55087 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AQP4P55087 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AQP4P55087 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AQP4P55087 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AQP4P55087 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AQP4P55087 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AQP4P55087 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AQP4P55087 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AQP4P55087 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AQP4P55087 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AQP4P55087 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AQP4P55087 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AQP4P55087 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AQP4P55087 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AQP4P55087 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AQP4P55087 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AQP4P55087 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AQP4P55087 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AQP4P55087 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AQP4P55087 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AQP4P55087 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AQP4P55087 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AQP4P55087 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AQP4P55087 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AQP4P55087 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AQP4P55087 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AQP4P55087 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AQP4P55087 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AQP4P55087 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms