Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H2P55055 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR1H2P55055 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1H2P55055 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1H2P55055 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms