Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRADP55042 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRADP55042 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRADP55042 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRADP55042 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms