Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RRADP55042 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRADP55042 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRADP55042 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRADP55042 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRADP55042 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRADP55042 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRADP55042 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRADP55042 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRADP55042 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRADP55042 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRADP55042 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRADP55042 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRADP55042 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRADP55042 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRADP55042 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRADP55042 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRADP55042 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRADP55042 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRADP55042 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms