Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMP3P54852 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMP3P54852 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMP3P54852 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMP3P54852 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMP3P54852 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMP3P54852 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EMP3P54852 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMP3P54852 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMP3P54852 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMP3P54852 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMP3P54852 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMP3P54852 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMP3P54852 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMP3P54852 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMP3P54852 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMP3P54852 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMP3P54852 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMP3P54852 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMP3P54852 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EMP3P54852 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMP3P54852 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMP3P54852 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMP3P54852 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMP3P54852 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMP3P54852 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMP3P54852 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMP3P54852 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMP3P54852 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMP3P54852 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMP3P54852 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMP3P54852 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMP3P54852 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms