Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGGT1BP53609 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGGT1BP53609 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGGT1BP53609 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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