Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MARCKSL1P49006 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCKSL1P49006 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCKSL1P49006 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCKSL1P49006 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms