Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AMTP48728 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMTP48728 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMTP48728 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMTP48728 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AMTP48728 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMTP48728 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMTP48728 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMTP48728 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMTP48728 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMTP48728 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMTP48728 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMTP48728 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMTP48728 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMTP48728 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMTP48728 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMTP48728 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMTP48728 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMTP48728 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AMTP48728 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AMTP48728 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AMTP48728 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AMTP48728 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AMTP48728 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AMTP48728 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms